Køling af foderpiller er afgørende i pelleteringsprocessen. Når man forlader pelletsmaskinen, er pillerne meget varme, bløde og fugtrige. Afkølingsprocessen køler dem ned til en temperatur lidt over stuetemperatur (3 grader - 5 grader) og reducerer deres fugtindhold til et sikkert niveau (mindre end eller lig med 12,5 %) til transport og opbevaring.
Modstrømskølere med både glidende gitter- og klapudløbsstrukturer kan tilpasses præcist til forskellige fodertyper i forskellige fodermøller. Efter afkøling og tørring sigtes de hele pellets eller ekstrudater for at fjerne fine partikler og spild for at bringe pellets til acceptabel størrelse. Pakkeoperationen begynder, når det færdige foder kommer ind i forsyningskassen over pakkeren og slutter, når poserne lægges på lager. Proceduren omfatter vejning af hver foderpose, anbringelse af vægtene i posen, lukning af posen, mærkning af posen, kodning af posen, palletering af posen og flytning af posen til lageret til opbevaring.
